Los trastornos temporomandibulares son unas patologías que afectan a la articulación y musculatura de la mandíbula en su punto de inserción en el cráneo, y que provocan dolores y molestias al masticar, así como cefaleas o migrañas. Para diagnosticarlas, se utiliza un escáner ATM en 3D, similar al TAC, pero centrado en la zona de inserción de la mandíbula en las posiciones de boca abierta y boca cerrada, obteniendo toda la información disponible .